Да, у меня все именно так. 2х4S. Общий силовой разъем не трогаешь.
Я брал плату переходник вызванивал где на балансирном разъеме 4S, подпаивал к ней разъем и заряжал. Т.е получается 2 платы и два вывода от балансирных разъемов. Током 3.7А заряжалось нормально.
В моем случае я просто в одном паке, заряжал по очереди 4 банки. Ну был у меня один балансир... Так что, если сильно хочется, можно попробовать.